《荒野大镖客2》辅助工具以功能多样性著称。Fikit辅助的“刷金条”功能支持单次生成500根金条，配合“藏宝图无限刷新”可实现日入千万美元。黄昏辅助的“天空魔改”功能允许玩家将游戏内天气改为“极光流星雨”，甚至将昼夜循环锁定为永恒黄昏。
任务辅助方面，Exodus辅助的“职业速通”模块可一键完成赏金猎人、商贩等职业满级，所需时间从30小时压缩至2小时。厄里斯辅助的“NPC控制”功能支持修改任务中NPC的台词与行为，例如让警长对玩家行礼。
娱乐功能突破想象。俄勒冈辅助的“哈利波特模组”可召唤雷暴咒攻击敌人，裂痕辅助的“宠物系统”允许玩家携带喷火龙坐骑。但需注意，滥用天气修改功能可能导致游戏崩溃，某玩家因将月亮尺寸调至50倍，触发内存溢出错误。